徐福东渡的传说在日本流传了两千多年，许多人把这位秦朝方士当成自家血脉的源头，可基因数据摆在那里，清楚得让人没法回避：日本人跟徐福没有多少直接的血缘联系。
《史记》里记载，秦始皇为求长生不老药，先后两次派徐福出海。第一次在公元前219年，徐福空手而归，说海上有大鱼阻路。第二次在公元前210年，规模大得多，带了三千童男童女、谷种、工匠和百样器具，从此再无消息。民间传说徐福一行到了“平原广泽”之地，定居下来，带去了农耕技术，成了当地人的祖先。
这个故事在日本落地生根。和歌山县、佐贺县、新宫市等地修建了徐福公园、神社和纪念碑，每年都有人去祭拜，把他当成农神、医神供奉。不少日本人觉得，自己的根就系在那批秦朝人身上，多少带点自豪。
可科学一步步把真相摊开。
日本列岛上的人类活动早就开始了，绳文人早在三万多年前就生活在这里，他们是本土的狩猎采集者，基因显示与东南亚古代人群、西伯利亚和东北亚古人都有联系，甚至跟台湾省原住民的远古祖先存在古老渊源。绳文人不是单一群体，不同地区还有明显差异，西日本到琉球一带跟北海道到东日本的线粒体DNA类型就不一样。
弥生时代从大约公元前300年开始，来自东北亚的人群经朝鲜半岛渡海而来，带来了水稻种植、金属工具和新的生活方式。他们跟绳文人长期融合，人口逐渐增加，农耕文明在岛上扎根。这个时间点，正好跟徐福出海的传说重合，但移民是分批、持续进行的，不是一次船队就能完成的。
古坟时代从公元3世纪中叶到7世纪末，又有一批东亚大陆人群迁入，带来了更复杂的社会组织形式。他们的基因跟新石器时代黄河中上游的古代中国人亲缘关系特别近。
2021年，国际研究团队在《科学进展》杂志发表论文，分析了12具绳文人、弥生人和古坟时代的人骨基因组，加上现代日本人样本，首次明确提出“三方起源”模型。绳文人贡献约9%到13%，弥生人带来的东北亚成分占主要部分，古坟人带来的东亚成分贡献最大，在现代日本人中达到71%左右，古坟时代后遗传结构基本稳定下来。
2024年，日本理化学研究所和东京大学团队又往前走了一大步。他们对日本全国7个地区3250多人的全基因组做了测序，确认日本人由绳文系、关西系和日本东北系三支祖先混血而成。关西地区的人跟新石器时代中晚期黄河及其上游地区的古代中国人遗传亲缘性明显，而日本东北地区的人跟绳文人亲缘更高。
这些研究里，徐福时代的秦代北方人基因特征，在现代日本人里找不到主导痕迹。弥生和古坟时期的移民早就把大陆血统带了进来，而且规模远超传说中那三千人。几千年过去，基因融合得彻底，就算徐福一行真到了日本，也只是其中很小一部分，早就被稀释得看不出了。
日本人祖先是多源融合的结果，绳文人提供本土基础，弥生和古坟时期的大陆移民带来农耕文明和国家雏形。徐福的传说更多成了文化交流的符号，代表中日之间早期的技术与人员往来，而不是血缘上的直系祖先。
如今，那些徐福神社还在，祭祀活动照常办，可大家心里明白，祖先的真相比传说更丰富、更复杂。基因检测把窗户纸捅破了，也让人对中日两国的历史联系有了更客观的认识。
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